โรงเรียนวัดอู่ข้าว แรกเริ่มเปิดเป็นโรงเรียนประชาบาลใช้ชื่อว่า “โรงเรียนประชาบาลตำบล
บึงตะเคียน 3” ได้เปิดทำการสอนเมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 2479 ตั้งแต่ระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ถึงระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 โดยอาศัยศาลาการเปรียญของวัดอู่ข้าว ซึ่งขณะนั้นมี นายเปิ้น แสงชัญ ทำหน้าที่เป็นครูใหญ่คนแรก และมีนายพุ่ม แสงเทศ ทำหน้าที่เป็นครูน้อย
พ.ศ. 2482 นายสิงห์ แก้วโสฬส ได้เข้ามาทำหน้าที่ครูใหญ่เป็นลำดับที่ 2
พ.ศ. 2484 นายหริ่ง พรรณสังข์ ได้เข้ามาทำหน้าที่ครูใหญ่เป็นลำดับที่ 3
พ.ศ. 2485 นายพุ่ม แสงเทศ ได้ทำหน้าที่ครูใหญ่เป็นลำดับที่ 4 พ.ศ. และในปีนี้
โรงเรียนเปลี่ยนชื่อจากเดิมเป็น “โรงเรียนประชาบาลตำบลคลองหก”
พ.ศ. 2496 นายอำนวย จันทแสง แรกเริ่มได้เข้ามาทำหน้าที่เป็นครูสอน ซึ่งต่อมา พ.ศ. 2500 ได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งครูใหญ่เป็นลำดับที่ 5 จนกระทั่งเกษียณอายุราชการ พ.ศ. 2538 ซึ่งในระหว่างช่วงเวลาดังกล่าว มีการเปลี่ยนแปลงเกิดขึ้น ดังนี้
- วันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2509 ทางราชการได้โอนโรงเรียนประชาบาลไปสังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัด และใช้อักษรย่อ จ.ปท. ติดที่คอเสื้อเครื่องแบบครู
- พ.ศ. 2513 ได้สร้างอาคารเรียน (แบบ ป.1 ข) หลังแรกบนที่ดินธรณีสงฆ์ ทางด้านทิศเหนือของวัด
- พ.ศ. 2515 โรงเรียนได้รับอนุญาตให้เปิดสอนในระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 5 ใช้อักษรย่อ ปท.73
- วันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2523 ทางราชการได้โอนโรงเรียนไปสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ
- พ.ศ. 2524 โรงเรียนเปลี่ยนชื่อจากเดิมคือ“โรงเรียนประชาบาลตำบลคลองหก” เป็น “โรงเรียนวัดอู่ข้าว” สังกัดสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ
- พ.ศ. 2529 โรงเรียนได้รับคำสั่งอนุญาตจากสำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดปทุมธานี ให้โรงเรียนเปิดสอนนักเรียนระดับชั้นอนุบาล 1
- พ.ศ. 2539 นายสวัสดิ์ กะบะเงิน ได้เข้ามาดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดอู่ข้าว จนถึงวันที่ 28 กันยายน 2555 ซึ่งในช่วงเวลาดังกล่าว มีการเปลี่ยนแปลงเกิดขึ้น ดังนี้
- พ.ศ. 2539 พระครูโกศล เขมกิจ เจ้าอาวาสวัดอู่ข้าว ได้ทำหนังสือยินยอมอนุญาตให้โรงเรียนใช้ที่ดินของวัดตามที่ใช้ประโยชน์อยู่ในปัจจุบัน ประมาณ 5 ไร่เศษ ให้กับทางโรงเรียนใช้สำหรับก่อสร้างอาคารเรียน อาคารประกอบ และใช้สอยประโยชน์เกี่ยวกับการศึกษา
- พ.ศ. 2541 ได้รับอนุญาตให้เปิดเป็นโรงเรียนขยายโอกาส และเริ่มเปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 จนกระทั่ง พ.ศ. 2542 มีการบังคับใช้กฎหมายการศึกษา นายสวัสดิ์ กะบะเงิน ได้รับการประเมินเพื่อเข้าสู่ตำแหน่งที่สูงขึ้น ในตำแหน่งผู้อำนวยการ เมื่อวันที่ 6 มิถุนายน พ.ศ.2544
- พ.ศ. 2546 โรงเรียนวัดอู่ข้าว โอนไปสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษา ขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ เนื่องจากการบังคับใช้กฎหมายพระราชบัญญัติว่าด้วยระเบียบกระทรวงศึกษาธิการ พ.ศ. 2546 ซึ่งระบบโครงสร้างการบริหารเปลี่ยนไป เป็นการจัดการศึกษาระบบแบ่งเขตพื้นที่ ทำให้หน่วยงานต้นสังกัดของโรงเรียนมีชื่อเรียกใหม่ เป็น “สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาปทุมธานี เขต 1” ซึ่งเวลาต่อมา พ.ศ. 2553 มีการแก้ไขกฎหมายการศึกษา การจัดการศึกษาระดับประถมศึกษาและมัธยมศึกษาได้แยกออกจากกัน จึงเปลี่ยนชื่อเรียกหน่วยงานต้นสังกัดใหม่อีกครั้ง เป็น “สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาปทุมธานี เขต 1”
- พ.ศ. 2555 นางงามเนตร เบ็ญมาศ ได้เข้ามาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดอู่ข้าว จนถึงวันที่ 10 พฤศจิกายน 2557 ในช่วงเวลาดังกล่าว ได้พัฒนาโรงเรียนหลายด้านด้วยกัน เช่น ด้านวิชาการ จัดทำแผนกลยุทธ์ให้สอดคล้องกับบริบทของโรงเรียน ได้ปรับปรุงภูมิทัศน์ภายในโรงเรียนให้เป็นแหล่งเรียนรู้ของนักเรียน ปรับปรุงอาคารเรียนอาคารประกอบการให้สวยงาม
ในช่วงที่ยังรอผู้บริหารท่านใหม่ นายสวง แสงเทศ ได้ทำหน้าที่รักษาราชแทนตำแหน่งผู้อำนวยการที่ยังว่างอยู่ ได้ทำหน้าที่บริหารงานต่างๆในโรงเรียน โดยอาศัยความร่วมมือจากคณะครู เจ้าหน้าที่ และบุคลากรทางการศึกษา ตลอดจนผู้ปกครองนักเรียน ด้วยดี
- พ.ศ. 2558 นางณัชธิญา ปัทมทัตตานนท์ ได้มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียน วัดอู่ข้าว เมื่อ เดือนมิถุนายน พ.ศ.2558 ได้พัฒนาการเรียนการสอน เช่นผลการสอบ O-net ปี 2558ระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 มีผลสัมฤทธิ์ดีมาก โดยเป็นที่ 1 ของโรงเรียนขยายโอกาสในเขตพื้นที่ปทุมธานี เขต1 ส่วนระดับประถมศึกษามีผลสัมฤทธิ์ดีขึ้น เป็นที่น่าพอใจ แต่ยังต้องปรับปรุงต่อไป ได้ปรับปรุงห้องสมุด อาคารโรงอาหาร สนามเด็กเล่น บ้านพักครู และอื่นๆ
- พ.ศ. 2559 ได้เข้าร่วมโครงการโรงเรียนประชารัฐ
- พ.ศ.2559 ประเมินโรงเรียนดีประจำตำบล
- พ.ศ.2559 ได้รับการสนับสนุนงบประมาณจากโรงไฟฟ้าวังน้อย สร้างบ้านพักครูจำนวน 1 หลัง เป็นเงินงบประมาณจำนวน 533,000 บาท
- พ.ศ.2559 ได้รับรางวัลดีเยี่ยม 1 โรงเรียน 1 อาชีพ 1 ผลิตภัณฑ์
ในช่วงที่ยังรอผู้บริหารท่านใหม่ นางอุมากร อ้อยตาล ได้ทำหน้าที่รักษาราชแทน
ตำแหน่งผู้อำนวยการที่ยังว่างอยู่ ได้ทำหน้าที่บริหารงานต่างๆในโรงเรียน โดยอาศัยความร่วมมือจากคณะครู เจ้าหน้าที่ และบุคลากรทางการศึกษา ตลอดจนผู้ปกครองนักเรียน ด้วยดี
- พ.ศ. ๒๕๖๒ นายถนอม พิระขัมม์ ได้ย้ายจากโรงเรียนวัดเขกขัมมาราม อำเภอลาดหลุมแก้ว มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดอู่ข้าวจนถึงปัจจุบัน ผลสอบ O-net ปีการศึกษา 25๖๒ ระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ มีผลสัมฤทธิ์เพิ่มขึ้นทุกรายวิชา ส่วนมัธยมศึกษามีผลสัมฤทธิ์ทางคณิตศาสตร์เพิ่มขึ้น แต่ในทุกรายวิชายังต้องปรับปรุงต่อไป ได้ปรับปรุงภูมิทัศน์ของโรงเรียน ได้ปรับปรุงห้อง STEM โรงอาหาร ห้องสุขา สุขสรรค์ บ้านพักครูและปรับปรุงภูมิทัศน์ด้านอื่น ๆ พ.ศ. ๒๕๖๓ ได้ส่งนักเรียนในระดับประถมศึกษาและระดับมัธยมศึกษาประเภททีม ๕ คน เข้าร่วมแข่งขันสวดมนต์หมู่ทำนองสรภัญญะในระดับจังหวัดปทุมธานี ได้ในระดับ ๕ ของจังหวัดปทุมธานี